37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3624 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3624  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653397  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3947  hypothetical protein  65.69 
 
 
281 aa  367  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.519499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4585  hypothetical protein  45.96 
 
 
310 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.552031  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5885  hypothetical protein  40.27 
 
 
309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1696  hypothetical protein  42.65 
 
 
304 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0637378  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1537  hypothetical protein  41.11 
 
 
313 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270816  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2113  hypothetical protein  41.09 
 
 
320 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7195  hypothetical protein  39.85 
 
 
306 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.7944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2128  hypothetical protein  41.82 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5355  hypothetical protein  39.56 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00203368  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2594  hypothetical protein  39.37 
 
 
313 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345899  hitchhiker  0.00464449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0663  putative periplasmic protein  38.93 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.592968  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1474  hypothetical protein  39.45 
 
 
304 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.825893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1375  hypothetical protein  34.81 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2411  hypothetical protein  35.27 
 
 
297 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3517  hypothetical protein  37.59 
 
 
297 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2258  hypothetical protein  37.59 
 
 
297 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3040  hypothetical protein  37.04 
 
 
301 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0176  probable secreted protein  37.3 
 
 
263 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0171  hypothetical protein  36.9 
 
 
263 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0179  probable secreted protein  36.9 
 
 
263 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0170  hypothetical protein  36.9 
 
 
263 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0170  hypothetical protein  36.11 
 
 
263 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0886  hypothetical protein  35.64 
 
 
308 aa  158  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1461  hypothetical protein  34.69 
 
 
338 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.438703  hitchhiker  0.00249113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1198  hypothetical protein  32.32 
 
 
325 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.477768  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2666  hypothetical protein  33.44 
 
 
318 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1212  hypothetical protein  32.06 
 
 
325 aa  148  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0331476  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2394  hypothetical protein  33.45 
 
 
318 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0178695  decreased coverage  0.00206259 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5200  hypothetical protein  32.48 
 
 
316 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0575835  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0539  hypothetical protein  31.34 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.192006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2322  hypothetical protein  30.42 
 
 
344 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.101209  normal  0.675092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0418  hypothetical protein  30.22 
 
 
314 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4036  hypothetical protein  32.06 
 
 
312 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675198  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4078  hypothetical protein  31.06 
 
 
332 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.658142  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3788  hypothetical protein  31.27 
 
 
326 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0404  hypothetical protein  31.63 
 
 
338 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>