37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2128 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2128  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2113  hypothetical protein  77.16 
 
 
320 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1537  hypothetical protein  63.86 
 
 
313 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270816  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2594  hypothetical protein  63.84 
 
 
313 aa  401  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345899  hitchhiker  0.00464449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1474  hypothetical protein  64.09 
 
 
304 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.825893 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4585  hypothetical protein  47.8 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.552031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1375  hypothetical protein  44.9 
 
 
298 aa  245  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5355  hypothetical protein  46.67 
 
 
301 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00203368  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2411  hypothetical protein  44.15 
 
 
297 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7195  hypothetical protein  44.1 
 
 
306 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.7944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2258  hypothetical protein  45.55 
 
 
297 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1696  hypothetical protein  43 
 
 
304 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0637378  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3517  hypothetical protein  45.2 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5885  hypothetical protein  44.04 
 
 
309 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2666  hypothetical protein  40.75 
 
 
318 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3040  hypothetical protein  42.47 
 
 
301 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0539  hypothetical protein  40.38 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.192006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0663  putative periplasmic protein  40.28 
 
 
264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.592968  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2322  hypothetical protein  37.65 
 
 
344 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.101209  normal  0.675092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0418  hypothetical protein  39.18 
 
 
314 aa  209  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1198  hypothetical protein  38.49 
 
 
325 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.477768  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3624  hypothetical protein  41.03 
 
 
280 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1461  hypothetical protein  45.12 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.438703  hitchhiker  0.00249113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1212  hypothetical protein  37.95 
 
 
325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0331476  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0179  probable secreted protein  39.78 
 
 
263 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5200  hypothetical protein  35.74 
 
 
316 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0575835  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0171  hypothetical protein  39.78 
 
 
263 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0170  hypothetical protein  39.78 
 
 
263 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4078  hypothetical protein  40.56 
 
 
332 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.658142  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0886  hypothetical protein  41.04 
 
 
308 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0176  probable secreted protein  39.42 
 
 
263 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0170  hypothetical protein  39.42 
 
 
263 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2394  hypothetical protein  37.11 
 
 
318 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0178695  decreased coverage  0.00206259 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3947  hypothetical protein  40.35 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.519499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0404  hypothetical protein  45.02 
 
 
338 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4036  hypothetical protein  36.75 
 
 
312 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675198  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3788  hypothetical protein  35.37 
 
 
326 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>