38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5885 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5885  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7195  hypothetical protein  69.06 
 
 
306 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.7944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1696  hypothetical protein  59.66 
 
 
304 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0637378  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5355  hypothetical protein  62.59 
 
 
301 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00203368  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4585  hypothetical protein  54.79 
 
 
310 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.552031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1375  hypothetical protein  44.3 
 
 
298 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2411  hypothetical protein  43.84 
 
 
297 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3517  hypothetical protein  45.45 
 
 
297 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2258  hypothetical protein  44.73 
 
 
297 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2113  hypothetical protein  46.29 
 
 
320 aa  242  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1537  hypothetical protein  43.87 
 
 
313 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270816  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2594  hypothetical protein  43.48 
 
 
313 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345899  hitchhiker  0.00464449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3040  hypothetical protein  43.46 
 
 
301 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2128  hypothetical protein  44.09 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0418  hypothetical protein  43.36 
 
 
314 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2394  hypothetical protein  40.82 
 
 
318 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0178695  decreased coverage  0.00206259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1474  hypothetical protein  42.21 
 
 
304 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.825893 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3624  hypothetical protein  40.27 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1212  hypothetical protein  39.38 
 
 
325 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0331476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1461  hypothetical protein  41.5 
 
 
338 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.438703  hitchhiker  0.00249113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2666  hypothetical protein  39.67 
 
 
318 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0663  putative periplasmic protein  40.29 
 
 
264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.592968  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1198  hypothetical protein  38.8 
 
 
325 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.477768  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5200  hypothetical protein  40.15 
 
 
316 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0575835  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0539  hypothetical protein  39.29 
 
 
307 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.192006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2322  hypothetical protein  39.93 
 
 
344 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.101209  normal  0.675092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4078  hypothetical protein  40.32 
 
 
332 aa  205  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.658142  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0886  hypothetical protein  39.93 
 
 
308 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3788  hypothetical protein  40.64 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3947  hypothetical protein  39.41 
 
 
281 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.519499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4036  hypothetical protein  35.78 
 
 
312 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675198  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0170  hypothetical protein  40.59 
 
 
263 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0171  hypothetical protein  40.59 
 
 
263 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0179  probable secreted protein  40.59 
 
 
263 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0170  hypothetical protein  40.22 
 
 
263 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0176  probable secreted protein  40.22 
 
 
263 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0404  hypothetical protein  41.44 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3519  hypothetical protein  54.1 
 
 
173 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>