37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2113 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2113  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  655    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2128  hypothetical protein  77.16 
 
 		 321 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1537  hypothetical protein  60.95 
 
 		 313 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270816  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1474  hypothetical protein  63.48 
 
 		 304 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.825893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2594  hypothetical protein  63.6 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345899  hitchhiker  0.00464449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4585  hypothetical protein  47.21 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.552031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1375  hypothetical protein  45.27 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1696  hypothetical protein  45.48 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0637378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5355  hypothetical protein  45.91 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00203368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2411  hypothetical protein  44.52 
 
 		 297 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5885  hypothetical protein  46.4 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7195  hypothetical protein  44.44 
 
 		 306 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.7944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3517  hypothetical protein  44.72 
 
 		 297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2258  hypothetical protein  44.37 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3040  hypothetical protein  42.24 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3624  hypothetical protein  40.61 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653397  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0663  putative periplasmic protein  41.46 
 
 		 264 aa  215  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.592968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2322  hypothetical protein  37.35 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.101209  normal  0.675092 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0539  hypothetical protein  38.83 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.192006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2666  hypothetical protein  39.6 
 
 		 318 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3947  hypothetical protein  42.96 
 
 		 281 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.519499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0418  hypothetical protein  38.83 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0179  probable secreted protein  41.11 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0171  hypothetical protein  41.11 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0170  hypothetical protein  41.11 
 
 		 263 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0176  probable secreted protein  40.74 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0170  hypothetical protein  40.74 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0886  hypothetical protein  39.32 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1212  hypothetical protein  36.62 
 
 		 325 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0331476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1461  hypothetical protein  43.26 
 
 		 338 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.438703  hitchhiker  0.00249113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1198  hypothetical protein  37.46 
 
 		 325 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.477768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5200  hypothetical protein  33.75 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0575835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2394  hypothetical protein  36.13 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0178695  decreased coverage  0.00206259 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4078  hypothetical protein  39.22 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.658142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0404  hypothetical protein  43.6 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4036  hypothetical protein  35.11 
 
 		 312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3788  hypothetical protein  31.29 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>