37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0418 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0418  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2666  hypothetical protein  55.87 
 
 
318 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1198  hypothetical protein  52.58 
 
 
325 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.477768  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1212  hypothetical protein  54.17 
 
 
325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0331476  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2322  hypothetical protein  47.9 
 
 
344 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.101209  normal  0.675092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1461  hypothetical protein  53.57 
 
 
338 aa  299  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.438703  hitchhiker  0.00249113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0886  hypothetical protein  47.87 
 
 
308 aa  278  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0539  hypothetical protein  45.25 
 
 
307 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.192006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4078  hypothetical protein  44.03 
 
 
332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.658142  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0404  hypothetical protein  47.67 
 
 
338 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7195  hypothetical protein  43.66 
 
 
306 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.7944 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2411  hypothetical protein  42.67 
 
 
297 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3517  hypothetical protein  43.66 
 
 
297 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2258  hypothetical protein  43.31 
 
 
297 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5885  hypothetical protein  43 
 
 
309 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1375  hypothetical protein  40.07 
 
 
298 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1696  hypothetical protein  41.22 
 
 
304 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0637378  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4585  hypothetical protein  39.2 
 
 
310 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.552031  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2394  hypothetical protein  38.22 
 
 
318 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0178695  decreased coverage  0.00206259 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3040  hypothetical protein  41.52 
 
 
301 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5355  hypothetical protein  42.2 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00203368  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3788  hypothetical protein  39.75 
 
 
326 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5200  hypothetical protein  38.62 
 
 
316 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0575835  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1537  hypothetical protein  38.82 
 
 
313 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270816  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2128  hypothetical protein  39.02 
 
 
321 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2594  hypothetical protein  40.51 
 
 
313 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.345899  hitchhiker  0.00464449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4036  hypothetical protein  39.31 
 
 
312 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.675198  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1474  hypothetical protein  46.86 
 
 
304 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.825893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2113  hypothetical protein  38.83 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0663  putative periplasmic protein  35.11 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.592968  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0170  hypothetical protein  35.42 
 
 
263 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0171  hypothetical protein  35.42 
 
 
263 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0179  probable secreted protein  35.42 
 
 
263 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0176  probable secreted protein  35.07 
 
 
263 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0170  hypothetical protein  34.38 
 
 
263 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3624  hypothetical protein  30.2 
 
 
280 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.653397  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3947  hypothetical protein  31.48 
 
 
281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.519499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>