36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2709 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  834    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  47.99 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  53.97 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  47.8 
 
 		 408 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  43.65 
 
 		 416 aa  295  9e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  47.1 
 
 		 372 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  41.94 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  42.11 
 
 		 383 aa  249  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  34.42 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  42.33 
 
 		 485 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  38.81 
 
 		 481 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  38.52 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  33.73 
 
 		 485 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  33.73 
 
 		 485 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  33.43 
 
 		 480 aa  170  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  32.78 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2956  hypothetical protein  37.8 
 
 		 538 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.48532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  34.59 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4526  hypothetical protein  39.91 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1133  hypothetical protein  37.32 
 
 		 539 aa  140  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0965  protein of unknown function DUF459  38.83 
 
 		 561 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0771  hypothetical protein  38.65 
 
 		 565 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6961  hypothetical protein  36.06 
 
 		 600 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4364  hypothetical protein  40.1 
 
 		 547 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0459  hypothetical protein  30.9 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  28.7 
 
 		 331 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0817  hypothetical protein  30.93 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3912  hypothetical protein  26.85 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  26.18 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4626  GDSL family lipase  32.12 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0639  hypothetical protein  26.6 
 
 		 336 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.962906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1060  hypothetical protein  26.11 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.93231  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0713  hypothetical protein  27.67 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1301  hypothetical protein  29.19 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0016  hypothetical protein  25.16 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1336  hypothetical protein  23.36 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00372863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>