36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3315 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  100 
 
 
403 aa  815    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  93.56 
 
 
404 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  49.12 
 
 
408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  46.45 
 
 
416 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  46.96 
 
 
383 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  42.21 
 
 
416 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  46.62 
 
 
383 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  44.07 
 
 
372 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  38.26 
 
 
474 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  35.29 
 
 
485 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  38.94 
 
 
409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  38.92 
 
 
481 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  31.63 
 
 
480 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  32.23 
 
 
485 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  32.23 
 
 
485 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  31.29 
 
 
432 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4526  hypothetical protein  29.1 
 
 
540 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1133  hypothetical protein  28.97 
 
 
539 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2956  hypothetical protein  36.02 
 
 
538 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.48532  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4364  hypothetical protein  37.04 
 
 
547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242924  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6961  hypothetical protein  35.24 
 
 
600 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0771  hypothetical protein  35.38 
 
 
565 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  30.15 
 
 
428 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0965  protein of unknown function DUF459  33.48 
 
 
561 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  28.37 
 
 
331 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0459  hypothetical protein  28.11 
 
 
299 aa  92  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0817  hypothetical protein  29.15 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3912  hypothetical protein  26.75 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4626  GDSL family lipase  27.27 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0016  hypothetical protein  23.65 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1336  hypothetical protein  24.37 
 
 
465 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00372863  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  23.17 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1301  hypothetical protein  26.45 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0639  hypothetical protein  22.5 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.962906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1060  hypothetical protein  22 
 
 
332 aa  54.7  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.93231  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0713  hypothetical protein  22 
 
 
336 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>