30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0016 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0016  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  727    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0713  hypothetical protein  28.93 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1060  hypothetical protein  26.47 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.93231  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0639  hypothetical protein  33.65 
 
 
336 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.962906  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  28.23 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1336  hypothetical protein  27.49 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00372863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  25 
 
 
474 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  26.42 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  24.3 
 
 
480 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  24.4 
 
 
485 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  25.23 
 
 
485 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  25.23 
 
 
485 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0459  hypothetical protein  23.02 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  23.33 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  25.99 
 
 
481 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  24.02 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  22 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  21.1 
 
 
383 aa  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  25.62 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1301  hypothetical protein  26.57 
 
 
358 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  23.67 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0817  hypothetical protein  26.7 
 
 
377 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  20.25 
 
 
383 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  25.16 
 
 
416 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4626  GDSL family lipase  25.25 
 
 
257 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3912  hypothetical protein  25.47 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  23.53 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  22.03 
 
 
396 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  26.79 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0965  protein of unknown function DUF459  22.52 
 
 
561 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>