36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0038 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  935    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  59.56 
 
 
480 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  56.74 
 
 
485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  56.74 
 
 
485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  54.14 
 
 
485 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  56.15 
 
 
481 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  38.37 
 
 
409 aa  226  9e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  34 
 
 
432 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  38.83 
 
 
416 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  34.42 
 
 
416 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  38.26 
 
 
403 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  36.57 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  33.83 
 
 
383 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  33.53 
 
 
383 aa  170  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  38.84 
 
 
372 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4526  hypothetical protein  32.67 
 
 
540 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  34.33 
 
 
428 aa  160  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  38 
 
 
408 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2956  hypothetical protein  40.56 
 
 
538 aa  145  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.48532  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6961  hypothetical protein  38.4 
 
 
600 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1133  hypothetical protein  37.6 
 
 
539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4364  hypothetical protein  38.75 
 
 
547 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242924  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0965  protein of unknown function DUF459  39.08 
 
 
561 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0771  hypothetical protein  35.15 
 
 
565 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  31.25 
 
 
331 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0639  hypothetical protein  30.57 
 
 
336 aa  95.9  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.962906  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0713  hypothetical protein  30.05 
 
 
336 aa  93.2  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1060  hypothetical protein  30.05 
 
 
332 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.93231  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  29.44 
 
 
396 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0459  hypothetical protein  31.36 
 
 
299 aa  86.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0016  hypothetical protein  25.85 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0817  hypothetical protein  31.19 
 
 
377 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3912  hypothetical protein  29.52 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1336  hypothetical protein  23.94 
 
 
465 aa  66.6  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00372863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1301  hypothetical protein  32.41 
 
 
358 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4626  GDSL family lipase  28.14 
 
 
257 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.105964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>