32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0817 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0817  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  740    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3912  hypothetical protein  61.72 
 
 
349 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1301  hypothetical protein  36.24 
 
 
358 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1336  hypothetical protein  23.49 
 
 
465 aa  100  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00372863  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  32.49 
 
 
372 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  32 
 
 
383 aa  93.6  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  32.72 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  31.5 
 
 
383 aa  92  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0459  hypothetical protein  30.99 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  30.15 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  34.01 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  31.43 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  30.93 
 
 
416 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  33.16 
 
 
485 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  29.15 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  28.72 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  31.19 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  28.36 
 
 
416 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  27.08 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0713  hypothetical protein  25.13 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  28.35 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1060  hypothetical protein  25.13 
 
 
332 aa  67  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.93231  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  28.84 
 
 
432 aa  66.6  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4626  GDSL family lipase  31.16 
 
 
257 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  27.54 
 
 
485 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0639  hypothetical protein  24.12 
 
 
336 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.962906  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  27.54 
 
 
485 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0016  hypothetical protein  26.7 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  27.98 
 
 
428 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  43.48 
 
 
2449 aa  47  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  45.83 
 
 
2397 aa  43.9  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1133  hypothetical protein  26.72 
 
 
539 aa  43.1  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>