28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6961 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6961  hypothetical protein  100 
 
 		 600 aa  1176    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0771  hypothetical protein  62.98 
 
 		 565 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1133  hypothetical protein  63.35 
 
 		 539 aa  534  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2956  hypothetical protein  61.49 
 
 		 538 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.48532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4526  hypothetical protein  57.17 
 
 		 540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4364  hypothetical protein  59.63 
 
 		 547 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0965  protein of unknown function DUF459  57.64 
 
 		 561 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  37.29 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  39.24 
 
 		 474 aa  145  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  36.91 
 
 		 485 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  36.06 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  32.28 
 
 		 481 aa  127  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  32.05 
 
 		 480 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  39.65 
 
 		 409 aa  126  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  33.61 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  33.61 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  37.5 
 
 		 408 aa  125  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  37.75 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  36.19 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  40.76 
 
 		 372 aa  118  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  35.24 
 
 		 403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  37.98 
 
 		 383 aa  115  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  39.42 
 
 		 383 aa  114  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  33.33 
 
 		 416 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  30.43 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  27.03 
 
 		 396 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  48.24 
 
 		 285 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.77 
 
 		 2449 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>