29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4364 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4526  hypothetical protein  81.62 
 
 		 540 aa  760    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4364  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1078    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.242924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0965  protein of unknown function DUF459  69.24 
 
 		 561 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0771  hypothetical protein  70.25 
 
 		 565 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6961  hypothetical protein  59.85 
 
 		 600 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2956  hypothetical protein  59.26 
 
 		 538 aa  525  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.48532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1133  hypothetical protein  64.63 
 
 		 539 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3055  hypothetical protein  30.22 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0038  hypothetical protein  38.75 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.034989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2709  hypothetical protein  40.1 
 
 		 416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1173  protein of unknown function DUF459  36.91 
 
 		 485 aa  140  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235474  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1975  hypothetical protein  38.22 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3613  protein of unknown function DUF459  39.53 
 
 		 404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3469  protein of unknown function DUF459  35.06 
 
 		 480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1808  hypothetical protein  34.31 
 
 		 481 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3315  protein of unknown function DUF459  37.21 
 
 		 403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3880  protein of unknown function DUF459  33.05 
 
 		 409 aa  127  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.194978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3595  protein of unknown function DUF459  35.32 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3728  hypothetical protein  36.11 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3271  hypothetical protein  35.32 
 
 		 485 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.523182 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4274  hypothetical protein  40.19 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0057  hypothetical protein  36.41 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0052  hypothetical protein  35.92 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2741  hypothetical protein  35.47 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1957  hypothetical protein  30.34 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3458  GDSL family lipase  30.1 
 
 		 396 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280309  normal  0.0118251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0459  hypothetical protein  36 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0713  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  43.9  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0639  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  43.9  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.962906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>