39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0209 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0209  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0240  hypothetical protein  86.27 
 
 		 157 aa  278  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00662928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0268  hypothetical protein  84.62 
 
 		 157 aa  277  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0642  hypothetical protein  82.69 
 
 		 157 aa  270  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0325  hypothetical protein  75.97 
 
 		 160 aa  250  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0251  hypothetical protein  76.62 
 
 		 160 aa  248  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0189  hypothetical protein  72.61 
 
 		 161 aa  246  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4278  hypothetical protein  64.1 
 
 		 163 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0248  hypothetical protein  63.46 
 
 		 167 aa  214  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5021  hypothetical protein  64.1 
 
 		 163 aa  213  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0287  hypothetical protein  62.66 
 
 		 164 aa  212  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4349  hypothetical protein  62.18 
 
 		 163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144205  normal  0.0875589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0898  hypothetical protein  63.06 
 
 		 168 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1232  hypothetical protein  63.4 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4416  hypothetical protein  61.69 
 
 		 163 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0522  hypothetical protein  63.69 
 
 		 173 aa  207  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4791  hypothetical protein  62.18 
 
 		 162 aa  203  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2637  hypothetical protein  62.18 
 
 		 162 aa  202  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00414066  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3513  hypothetical protein  64.47 
 
 		 160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3071  hypothetical protein  61.78 
 
 		 162 aa  197  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1938  hypothetical protein  62.5 
 
 		 170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1983  hypothetical protein  61.84 
 
 		 174 aa  194  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2260  hypothetical protein  61.84 
 
 		 174 aa  194  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0667  hypothetical protein  61.18 
 
 		 162 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.303443  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3587  hypothetical protein  56.88 
 
 		 163 aa  188  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  0.827842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2770  hypothetical protein  63.58 
 
 		 161 aa  181  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2882  hypothetical protein  53.9 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0653586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0765  hypothetical protein  54.94 
 
 		 165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.130254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3562  hypothetical protein  52.87 
 
 		 159 aa  171  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.707047  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0631  hypothetical protein  53.55 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2283  hypothetical protein  54.19 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.378962  normal  0.208012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1958  hypothetical protein  53.59 
 
 		 162 aa  167  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0415908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0980  hypothetical protein  52.6 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0594  hypothetical protein  52.9 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0143  hypothetical protein  52.8 
 
 		 164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4052  hypothetical protein  52.56 
 
 		 183 aa  159  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1128  hypothetical protein  54.93 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.843094  normal  0.0689273 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0160  hypothetical protein  47.37 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.632416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1909  hypothetical protein  44.53 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.14779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>