39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0248 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0248  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  343  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0287  hypothetical protein  93.94 
 
 
164 aa  312  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5021  hypothetical protein  91.93 
 
 
163 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4278  hypothetical protein  89.7 
 
 
163 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4349  hypothetical protein  90.06 
 
 
163 aa  299  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144205  normal  0.0875589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4416  hypothetical protein  87.88 
 
 
163 aa  297  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0898  hypothetical protein  86.5 
 
 
168 aa  290  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4791  hypothetical protein  64.24 
 
 
162 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0240  hypothetical protein  67.11 
 
 
157 aa  221  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00662928  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0251  hypothetical protein  67.32 
 
 
160 aa  220  9e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0189  hypothetical protein  65.16 
 
 
161 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0325  hypothetical protein  67.32 
 
 
160 aa  217  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0268  hypothetical protein  65.13 
 
 
157 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2637  hypothetical protein  62.42 
 
 
162 aa  216  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00414066  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1232  hypothetical protein  66.01 
 
 
164 aa  216  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0209  hypothetical protein  63.46 
 
 
158 aa  214  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0522  hypothetical protein  62.2 
 
 
173 aa  213  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0642  hypothetical protein  60.53 
 
 
157 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3071  hypothetical protein  58.18 
 
 
162 aa  203  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1938  hypothetical protein  61.15 
 
 
170 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2260  hypothetical protein  59.88 
 
 
174 aa  200  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252574  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1983  hypothetical protein  59.88 
 
 
174 aa  200  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3513  hypothetical protein  61.44 
 
 
160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0667  hypothetical protein  58.49 
 
 
162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.303443  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3587  hypothetical protein  54.32 
 
 
163 aa  186  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  0.827842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2770  hypothetical protein  57.62 
 
 
161 aa  177  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0765  hypothetical protein  52.17 
 
 
165 aa  174  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.130254  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1128  hypothetical protein  54.84 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.843094  normal  0.0689273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0631  hypothetical protein  53.85 
 
 
158 aa  167  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2283  hypothetical protein  53.85 
 
 
158 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.378962  normal  0.208012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0594  hypothetical protein  53.21 
 
 
158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3562  hypothetical protein  51.59 
 
 
159 aa  163  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.707047  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2882  hypothetical protein  52.32 
 
 
156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0653586  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1958  hypothetical protein  50.64 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0415908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4052  hypothetical protein  47.62 
 
 
183 aa  157  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0980  hypothetical protein  49.35 
 
 
159 aa  157  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0143  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  148  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0160  hypothetical protein  44.16 
 
 
162 aa  125  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.632416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1909  hypothetical protein  43.37 
 
 
170 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.14779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>