39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5021 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5021  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4349  hypothetical protein  96.32 
 
 		 163 aa  326  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144205  normal  0.0875589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4278  hypothetical protein  95.71 
 
 		 163 aa  323  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4416  hypothetical protein  93.87 
 
 		 163 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0248  hypothetical protein  91.93 
 
 		 167 aa  305  3e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0287  hypothetical protein  90.74 
 
 		 164 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0898  hypothetical protein  87.73 
 
 		 168 aa  297  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1232  hypothetical protein  62.8 
 
 		 164 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4791  hypothetical protein  64.42 
 
 		 162 aa  217  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0251  hypothetical protein  65.19 
 
 		 160 aa  216  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0240  hypothetical protein  65.13 
 
 		 157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00662928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0209  hypothetical protein  64.1 
 
 		 158 aa  213  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0325  hypothetical protein  65.81 
 
 		 160 aa  213  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0268  hypothetical protein  63.82 
 
 		 157 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2637  hypothetical protein  61.96 
 
 		 162 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00414066  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0189  hypothetical protein  61.64 
 
 		 161 aa  209  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0522  hypothetical protein  63.29 
 
 		 173 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1938  hypothetical protein  60.49 
 
 		 170 aa  207  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2260  hypothetical protein  62.03 
 
 		 174 aa  204  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1983  hypothetical protein  62.03 
 
 		 174 aa  204  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3513  hypothetical protein  62.75 
 
 		 160 aa  202  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0642  hypothetical protein  59.87 
 
 		 157 aa  201  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3071  hypothetical protein  57.67 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0667  hypothetical protein  56.52 
 
 		 162 aa  193  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.303443  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3587  hypothetical protein  53.8 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  0.827842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2770  hypothetical protein  55.21 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1128  hypothetical protein  53.55 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.843094  normal  0.0689273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0765  hypothetical protein  50.9 
 
 		 165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.130254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0631  hypothetical protein  53.85 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2283  hypothetical protein  52.56 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.378962  normal  0.208012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0594  hypothetical protein  53.21 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3562  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  163  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.707047  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2882  hypothetical protein  52.32 
 
 		 156 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0653586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4052  hypothetical protein  48.43 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1958  hypothetical protein  48.72 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0415908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0980  hypothetical protein  46.79 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0143  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1909  hypothetical protein  42.41 
 
 		 170 aa  124  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0160  hypothetical protein  43.42 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.632416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>