39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4416 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4416  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  336  7e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5021  hypothetical protein  93.87 
 
 		 163 aa  316  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4349  hypothetical protein  92.02 
 
 		 163 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144205  normal  0.0875589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4278  hypothetical protein  90.8 
 
 		 163 aa  310  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0248  hypothetical protein  87.88 
 
 		 167 aa  297  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0287  hypothetical protein  87.8 
 
 		 164 aa  294  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0898  hypothetical protein  84.85 
 
 		 168 aa  289  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4791  hypothetical protein  65.03 
 
 		 162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1232  hypothetical protein  66.45 
 
 		 164 aa  216  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0240  hypothetical protein  63.46 
 
 		 157 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00662928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0251  hypothetical protein  65.79 
 
 		 160 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2637  hypothetical protein  61.96 
 
 		 162 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00414066  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0268  hypothetical protein  64.86 
 
 		 157 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0325  hypothetical protein  65.79 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1938  hypothetical protein  62.66 
 
 		 170 aa  208  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0209  hypothetical protein  61.69 
 
 		 158 aa  208  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0522  hypothetical protein  65.56 
 
 		 173 aa  207  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0189  hypothetical protein  61.01 
 
 		 161 aa  206  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2260  hypothetical protein  61.88 
 
 		 174 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1983  hypothetical protein  61.88 
 
 		 174 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3513  hypothetical protein  62.75 
 
 		 160 aa  202  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0642  hypothetical protein  61.49 
 
 		 157 aa  200  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3071  hypothetical protein  57.06 
 
 		 162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0667  hypothetical protein  59.74 
 
 		 162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.303443  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3587  hypothetical protein  53.8 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  0.827842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2770  hypothetical protein  54.6 
 
 		 161 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0765  hypothetical protein  52.69 
 
 		 165 aa  174  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.130254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1128  hypothetical protein  53.55 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.843094  normal  0.0689273 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3562  hypothetical protein  50.64 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.707047  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0594  hypothetical protein  51.92 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0631  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2283  hypothetical protein  51.28 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.378962  normal  0.208012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2882  hypothetical protein  50.99 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0653586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1958  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  154  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0415908 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4052  hypothetical protein  47.74 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0143  hypothetical protein  49.69 
 
 		 164 aa  148  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0980  hypothetical protein  46.1 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1909  hypothetical protein  42.41 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0160  hypothetical protein  43.24 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.632416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>