39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0287 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0287  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  336  9.999999999999999e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0248  hypothetical protein  93.94 
 
 		 167 aa  312  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5021  hypothetical protein  90.74 
 
 		 163 aa  301  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4278  hypothetical protein  89.63 
 
 		 163 aa  300  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4349  hypothetical protein  88.89 
 
 		 163 aa  296  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144205  normal  0.0875589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4416  hypothetical protein  87.8 
 
 		 163 aa  294  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0898  hypothetical protein  85.45 
 
 		 168 aa  290  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0240  hypothetical protein  66.45 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00662928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4791  hypothetical protein  63.41 
 
 		 162 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0251  hypothetical protein  66.67 
 
 		 160 aa  217  7e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0189  hypothetical protein  63.29 
 
 		 161 aa  216  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2637  hypothetical protein  62.8 
 
 		 162 aa  214  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00414066  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0325  hypothetical protein  66.67 
 
 		 160 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0268  hypothetical protein  64.47 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0209  hypothetical protein  62.66 
 
 		 158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1232  hypothetical protein  61.82 
 
 		 164 aa  209  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0522  hypothetical protein  65.13 
 
 		 173 aa  207  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3071  hypothetical protein  59.15 
 
 		 162 aa  206  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0642  hypothetical protein  59.87 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1938  hypothetical protein  61.78 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2260  hypothetical protein  61.69 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1983  hypothetical protein  61.69 
 
 		 174 aa  198  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0667  hypothetical protein  59.09 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.303443  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3513  hypothetical protein  59.49 
 
 		 160 aa  194  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3587  hypothetical protein  55.06 
 
 		 163 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  0.827842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2770  hypothetical protein  57.52 
 
 		 161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1128  hypothetical protein  56.13 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.843094  normal  0.0689273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0765  hypothetical protein  50.6 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.130254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0631  hypothetical protein  53.85 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0594  hypothetical protein  54.49 
 
 		 158 aa  167  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2283  hypothetical protein  53.21 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.378962  normal  0.208012 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3562  hypothetical protein  49.38 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.707047  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2882  hypothetical protein  51.66 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0653586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4052  hypothetical protein  47.31 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1958  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0415908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0980  hypothetical protein  47.44 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0143  hypothetical protein  48.75 
 
 		 164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0160  hypothetical protein  44.16 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.632416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1909  hypothetical protein  43.98 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.14779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>