39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0522 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0522  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  354  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.114878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0240  hypothetical protein  64.33 
 
 
157 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00662928  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0248  hypothetical protein  62.2 
 
 
167 aa  213  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0268  hypothetical protein  63.06 
 
 
157 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0898  hypothetical protein  63.41 
 
 
168 aa  210  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5021  hypothetical protein  63.29 
 
 
163 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0642  hypothetical protein  63.06 
 
 
157 aa  207  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4278  hypothetical protein  60.87 
 
 
163 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4416  hypothetical protein  65.56 
 
 
163 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0287  hypothetical protein  65.13 
 
 
164 aa  207  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0209  hypothetical protein  63.69 
 
 
158 aa  207  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4349  hypothetical protein  62.03 
 
 
163 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144205  normal  0.0875589 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0325  hypothetical protein  62.96 
 
 
160 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0251  hypothetical protein  64.05 
 
 
160 aa  205  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1232  hypothetical protein  57.83 
 
 
164 aa  204  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2770  hypothetical protein  66.89 
 
 
161 aa  203  9e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2260  hypothetical protein  59.88 
 
 
174 aa  201  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252574  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1983  hypothetical protein  59.88 
 
 
174 aa  201  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0189  hypothetical protein  62.42 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1938  hypothetical protein  61.88 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4791  hypothetical protein  61.84 
 
 
162 aa  194  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2637  hypothetical protein  60.53 
 
 
162 aa  191  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00414066  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3513  hypothetical protein  61.84 
 
 
160 aa  191  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3071  hypothetical protein  57.42 
 
 
162 aa  188  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3587  hypothetical protein  58.13 
 
 
163 aa  187  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  0.827842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4052  hypothetical protein  52.54 
 
 
183 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0667  hypothetical protein  58.55 
 
 
162 aa  185  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.303443  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0765  hypothetical protein  59.62 
 
 
165 aa  183  8e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.130254  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1128  hypothetical protein  61.07 
 
 
160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.843094  normal  0.0689273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0631  hypothetical protein  58.44 
 
 
158 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3562  hypothetical protein  56.05 
 
 
159 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.707047  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2283  hypothetical protein  58.44 
 
 
158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.378962  normal  0.208012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0594  hypothetical protein  57.79 
 
 
158 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2882  hypothetical protein  57.62 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0653586  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1958  hypothetical protein  54.25 
 
 
162 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0415908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0980  hypothetical protein  54.25 
 
 
159 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0143  hypothetical protein  52.5 
 
 
164 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0160  hypothetical protein  49.66 
 
 
162 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.632416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1909  hypothetical protein  52.42 
 
 
170 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.14779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>