106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6298 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6298  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  459  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2098  hypothetical protein  46.48 
 
 
225 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3184  hypothetical protein  41.67 
 
 
223 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0223741  hitchhiker  0.00378402 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2605  hypothetical protein  29.19 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2042  hexapaptide repeat-containing transferase  28.83 
 
 
175 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3182  putative acetyltransferase  32.04 
 
 
185 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.621032  hitchhiker  0.00169424 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2880  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase WbbJ  28.57 
 
 
176 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3187  hexapaptide repeat-containing transferase  25.83 
 
 
202 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2268  hypothetical protein  25.52 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511074 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7339  transacetylase  25 
 
 
545 aa  52  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0206236  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_87610  predicted protein  31.93 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.568532  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3722  hypothetical protein  27.27 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0959  hexapaptide repeat-containing transferase  29.27 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.642505  normal  0.321102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09403  maltose O-acetyltransferase  27.34 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419805  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0430  acetyltransferase, putative  33.71 
 
 
175 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4165  transferase family protein  30.97 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.210704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1474  TDP-4-oxo-6-deoxy-D-glucose transaminase  25.3 
 
 
187 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.844119  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0645  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  30.43 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.1009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1059  transferase family protein  30.09 
 
 
174 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1011  acetyltransferase  29.77 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0285362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1510  acetyltransferase  28.81 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00118654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1454  anhydrase family 3 protein  29.2 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  32.65 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0940  acetyltransferase  28 
 
 
181 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.750437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0957  acetyltransferase  28 
 
 
181 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4267  hexapaptide repeat-containing transferase  29.2 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1877  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  31.9 
 
 
231 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2830  acetyltransferase  32.11 
 
 
176 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00579309  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3028  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase  21.62 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0131  acetyltransferase  24.77 
 
 
205 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2130  transferase hexapeptide repeat containing protein  35 
 
 
208 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4847  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.9 
 
 
550 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0521363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0758  acetyltransferase  35.42 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2138  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0562  putative acetyltransferase  26.42 
 
 
183 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0007487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1730  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.11 
 
 
195 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6403  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.79 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.552985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6269  putative acetyltransferase  24.5 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501907  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1078  putative acetyltransferase  26.47 
 
 
187 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520725  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  28.21 
 
 
185 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3106  hypothetical protein  30.33 
 
 
241 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000347381  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1814  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2-carboxylate N-succinyltransferase  28.45 
 
 
232 aa  45.4  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000825508  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5291  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.9 
 
 
550 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.111996 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3376  acetyltransferase  35.29 
 
 
208 aa  45.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003640  galactoside O-acetyltransferase  31.97 
 
 
199 aa  45.1  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.693048  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1347  ferripyochelin binding protein  24.83 
 
 
169 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1465  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  28.7 
 
 
174 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0476  serine O-acetyltransferase  32.31 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0293  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  30.63 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2617  hexapaptide repeat-containing transferase  34.72 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02207  hypothetical protein  31.36 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03419  O-acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11510)  29.67 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1961  maltose O-acetyltransferase  26.75 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  27.93 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15870  hypothetical protein  25.81 
 
 
174 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0689181 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  22.58 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.02096 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4339  hypothetical protein  24.39 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.257588  normal  0.0431137 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2577  hexapaptide repeat-containing transferase  31.82 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1129  hexapaptide repeat-containing transferase  22.48 
 
 
325 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2631  hexapaptide repeat-containing transferase  31.82 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.778978  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2730  hexapaptide repeat-containing transferase  33.33 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0688  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  27.03 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1690  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.71 
 
 
198 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0534677  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0078  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.26 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0084  putative sugar acetyltransferase  24.77 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546093  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1274  hexapaptide repeat-containing transferase  27.83 
 
 
174 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2926  hypothetical protein  23.53 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  32.2 
 
 
174 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  26.5 
 
 
185 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2480  putative acetyltransferase  38.78 
 
 
178 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00330566  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2116  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  31.19 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1502  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  27.18 
 
 
166 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2541  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  32.11 
 
 
171 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  35.85 
 
 
174 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  29.09 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  29.09 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0239  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  31.96 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2053  hexapaptide repeat-containing transferase  27.52 
 
 
173 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00296  galactoside O-acetyltransferase  33.85 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21865  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0688  acetyltransferase  26.56 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1222  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  29.75 
 
 
233 aa  43.1  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3590  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  29.06 
 
 
191 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00300  hypothetical protein  33.85 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.279411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4095  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  28 
 
 
182 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.977021 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3264  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.85 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0420  putative acetyltransferase  30.14 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.857208  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2655  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.33 
 
 
194 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3283  galactoside O-acetyltransferase  33.85 
 
 
201 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142249  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0832  Isoleucine patch superfamily acetyltransferase  34.92 
 
 
223 aa  42.4  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6061  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  26.13 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2197  putative sugar acetyltransferase  26.21 
 
 
220 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4278  acetyltransferase  22.92 
 
 
273 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298738  hitchhiker  0.0000105124 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0786  hexapaptide repeat-containing transferase  27.87 
 
 
161 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.758971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0803  hexapaptide repeat-containing transferase  27.87 
 
 
161 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  28.7 
 
 
174 aa  42  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0415  galactoside O-acetyltransferase  33.82 
 
 
203 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28841  predicted protein  30.19 
 
 
204 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1989  putative glycan acetyltransferase  30 
 
 
226 aa  42  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000266914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0251  galactoside O-acetyltransferase  32.53 
 
 
204 aa  42  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0630032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0290  acetyltransferase  29.82 
 
 
180 aa  41.6  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0175113 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>