24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5950 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  810    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  50.84 
 
 		 385 aa  357  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  41.48 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  43.92 
 
 		 392 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  43.98 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  38.13 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  36.36 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  37.4 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  35.77 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  36.88 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  34.16 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  31.71 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1258  conserved hypothetical protein, secreted  29.94 
 
 		 375 aa  158  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  25.57 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  22.19 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  27.95 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  23.81 
 
 		 355 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  24.59 
 
 		 321 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  23.35 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  25.94 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2037  hypothetical protein  25.29 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672069  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2973  hypothetical protein  23.95 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10348  hypothetical protein  24.49 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1629  hypothetical protein  24.76 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>