29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0954 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  790    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  38.59 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  32.5 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  30.9 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  31.71 
 
 		 400 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  30.1 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  30.14 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  29.57 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  28.84 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  25.28 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  26.39 
 
 		 383 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1258  conserved hypothetical protein, secreted  24.41 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  30.06 
 
 		 346 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  28.05 
 
 		 348 aa  95.9  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  25.07 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  27.89 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0261  hypothetical protein  28.63 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  26.38 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  27.41 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  24.93 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  23.22 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1212  hypothetical protein  26.48 
 
 		 324 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000090453  decreased coverage  1.89634e-17 
 
 
-
 
NC_002950  PG0602  hypothetical protein  23.3 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  26.64 
 
 		 321 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1492  hypothetical protein  23.53 
 
 		 378 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.914795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2973  hypothetical protein  26.94 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0602  hypothetical protein  24.74 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0852844  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10348  hypothetical protein  24.46 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2037  hypothetical protein  24.48 
 
 		 350 aa  46.6  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672069  normal  0.132796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>