24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4061 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  795    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  45.01 
 
 
394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  43.81 
 
 
386 aa  292  7e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  43.92 
 
 
400 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  42.04 
 
 
391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  40.75 
 
 
390 aa  277  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  42.86 
 
 
385 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  41.98 
 
 
402 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  40.05 
 
 
390 aa  259  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  38.08 
 
 
383 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  38.59 
 
 
386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  36.2 
 
 
376 aa  230  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1258  conserved hypothetical protein, secreted  35.38 
 
 
375 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  26.43 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  24.71 
 
 
344 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  25 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  28.63 
 
 
346 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2037  hypothetical protein  24.63 
 
 
350 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672069  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  24.75 
 
 
321 aa  56.2  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1629  hypothetical protein  25.23 
 
 
354 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  27.81 
 
 
351 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  24.54 
 
 
355 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  23.05 
 
 
361 aa  47  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1567  hypothetical protein  27.07 
 
 
354 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.338621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>