24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1756 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  702    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  53.47 
 
 
361 aa  329  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  30.61 
 
 
348 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  31.15 
 
 
351 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  29.21 
 
 
346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  27.41 
 
 
346 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  27.89 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  27.89 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  24.71 
 
 
392 aa  65.9  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  22.44 
 
 
394 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  22.19 
 
 
400 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  26.99 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  24.05 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  22.62 
 
 
390 aa  56.6  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  23.3 
 
 
391 aa  55.8  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10348  hypothetical protein  25.31 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12378  hypothetical protein  22.09 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260856  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  23.59 
 
 
385 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  21.2 
 
 
386 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  23.12 
 
 
321 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  23.16 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  22.38 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2755  hypothetical protein  24.43 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2037  hypothetical protein  24.76 
 
 
350 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672069  normal  0.132796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>