25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1183 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  805    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  49.86 
 
 
376 aa  344  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  45.01 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  46.33 
 
 
391 aa  302  6.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  41.48 
 
 
400 aa  290  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  40.31 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  41.65 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  38.92 
 
 
383 aa  270  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  38.16 
 
 
385 aa  262  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  39.21 
 
 
402 aa  246  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  37.08 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1258  conserved hypothetical protein, secreted  30.49 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  31.49 
 
 
386 aa  186  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  26.13 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  22.44 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  24.71 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  23 
 
 
348 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  26.45 
 
 
346 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  23.76 
 
 
346 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  23.95 
 
 
361 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2037  hypothetical protein  20.73 
 
 
350 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672069  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  20.17 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  23.86 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0261  hypothetical protein  22.43 
 
 
338 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10348  hypothetical protein  23.08 
 
 
344 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>