15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1682 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  793    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  50 
 
 
390 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  38.92 
 
 
394 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  38.08 
 
 
392 aa  257  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  38.48 
 
 
385 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  36.24 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  36.36 
 
 
400 aa  229  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  36.46 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  35.26 
 
 
402 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  33.6 
 
 
386 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  34.21 
 
 
376 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1258  conserved hypothetical protein, secreted  31.5 
 
 
375 aa  192  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  26.39 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  22.38 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1629  hypothetical protein  26.92 
 
 
354 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>