23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4247 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  778    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  50.84 
 
 		 400 aa  357  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  42.86 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  38.16 
 
 		 394 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  38.95 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1682  hypothetical protein  38.48 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  38.18 
 
 		 391 aa  225  8e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  37.4 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1610  hypothetical protein  33.68 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.834911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  34.97 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1258  conserved hypothetical protein, secreted  35.96 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4112  hypothetical protein  30.37 
 
 		 376 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.617644  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  30.36 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  21.66 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12378  hypothetical protein  30.25 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260856  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  27.69 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  22.73 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  23.59 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  27.78 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  28.4 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  25.13 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1212  hypothetical protein  30.98 
 
 		 324 aa  46.6  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000090453  decreased coverage  1.89634e-17 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2973  hypothetical protein  28.67 
 
 		 365 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>