28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2817 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2817  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  710    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0357  hypothetical protein  43.83 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0283  hypothetical protein  41.32 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2396  hypothetical protein  30.88 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1163  hypothetical protein  31.76 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.71803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1756  hypothetical protein  27.89 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000066418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1748  hypothetical protein  27.62 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1492  hypothetical protein  29.11 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.914795  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2991  hypothetical protein  33.53 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0954  hypothetical protein  27.41 
 
 		 386 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0602  hypothetical protein  24.66 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1555  hypothetical protein  25.37 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0435  hypothetical protein  25.93 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000000627827  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1212  hypothetical protein  25.88 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000090453  decreased coverage  1.89634e-17 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05465  hypothetical protein  25.87 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.346517  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5950  hypothetical protein  23.81 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4247  hypothetical protein  27 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1567  hypothetical protein  29.86 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.338621 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12378  hypothetical protein  30.94 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260856  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10348  hypothetical protein  24.3 
 
 		 344 aa  50.4  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3238  hypothetical protein  27.36 
 
 		 386 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4061  hypothetical protein  24.54 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0027  hypothetical protein  27.59 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1183  hypothetical protein  23.86 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2973  hypothetical protein  30.06 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1629  hypothetical protein  26.51 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2037  hypothetical protein  23.36 
 
 		 350 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672069  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0288  hypothetical protein  26.8 
 
 		 327 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>