29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5903 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 311 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  57.82 
 
 		 306 aa  354  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  42.72 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  39.24 
 
 		 294 aa  215  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  37.88 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  39.27 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  41.16 
 
 		 279 aa  195  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  40.21 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  40.29 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  34.92 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  35.66 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  35.69 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  34.01 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  34.27 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  33.22 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  31.34 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  33.87 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  32.44 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  32.58 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  29.93 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887000000000001e-20 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  46 
 
 		 102 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  46 
 
 		 102 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  25.44 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  29.88 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3080  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  23.89 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1147  hypothetical protein  24.87 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0503  hypothetical protein  23.77 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1441  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0828256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>