27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0232 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  649    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  64.14 
 
 
334 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  51.45 
 
 
318 aa  310  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  44.87 
 
 
300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  42.91 
 
 
281 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  39.86 
 
 
291 aa  192  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  40 
 
 
301 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  35.69 
 
 
311 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  36.4 
 
 
294 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  38.28 
 
 
294 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  36.98 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  37.46 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  34.95 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  37.95 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  32.97 
 
 
298 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  54.29 
 
 
102 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  54.29 
 
 
102 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  30.1 
 
 
299 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  29.37 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  29.21 
 
 
271 aa  96.7  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  29.46 
 
 
275 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  29.04 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  32.52 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  25.96 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  22.7 
 
 
277 aa  65.1  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887000000000001e-20 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3848  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3775  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>