21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3849 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  211  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  98.04 
 
 
300 aa  209  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  59.05 
 
 
318 aa  134  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  54.29 
 
 
313 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  54.29 
 
 
334 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  46 
 
 
311 aa  100  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  47.42 
 
 
291 aa  100  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  47 
 
 
301 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  46 
 
 
294 aa  98.6  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  47.42 
 
 
281 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  42.27 
 
 
294 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  41.18 
 
 
299 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  43.14 
 
 
279 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  40 
 
 
306 aa  85.5  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  38.71 
 
 
298 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  37.61 
 
 
324 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  34.26 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  31.96 
 
 
308 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  37.36 
 
 
306 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  34.07 
 
 
296 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>