23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3159 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  31.75 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  31.83 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  28.87 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  28.87 
 
 		 334 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  24.41 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  27.64 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  30.37 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  26.16 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  26.88 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  24.19 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  24.39 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  24.64 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  27.41 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  23.89 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  25.71 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  23.44 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  22.57 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0503  hypothetical protein  26.44 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  37.36 
 
 		 102 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  37.36 
 
 		 102 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  22.81 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  18.88 
 
 		 284 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>