25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0622 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  59.48 
 
 		 275 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  34.69 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  33.46 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  32.44 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  32.06 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  30.94 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  29.96 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  30.68 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  30.04 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  29.18 
 
 		 294 aa  99.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  29.54 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  23.93 
 
 		 308 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  25.65 
 
 		 298 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  27.46 
 
 		 318 aa  85.9  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  27.37 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  28.67 
 
 		 324 aa  82  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  29.21 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  30.8 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  26.84 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887000000000001e-20 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  25.71 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  23.44 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0503  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3080  hypothetical protein  31.72 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  30.65 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>