25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2225 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  44.44 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  35.82 
 
 
279 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  31.88 
 
 
306 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  34.26 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  32.3 
 
 
301 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  31.34 
 
 
311 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  29.41 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  33.81 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  32.75 
 
 
294 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  31.7 
 
 
299 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  29.31 
 
 
299 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  29.43 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  30.25 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  29.2 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  32.97 
 
 
313 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  32.34 
 
 
324 aa  99.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  25.65 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  24.04 
 
 
284 aa  85.9  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  26.1 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  23.79 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887000000000001e-20 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  38.71 
 
 
102 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  38.71 
 
 
102 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  24.64 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  25.14 
 
 
296 aa  57  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>