27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1152 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  687    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  64.14 
 
 		 313 aa  391  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  48.06 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  43.04 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  39.87 
 
 		 291 aa  199  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  40.78 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  38.76 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  40.21 
 
 		 301 aa  175  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  37.76 
 
 		 294 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  36.17 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  34.27 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  34.15 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  32.64 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  33.81 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  36.93 
 
 		 324 aa  132  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  54.29 
 
 		 102 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  54.29 
 
 		 102 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  27.85 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  29.23 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  27.27 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  28.87 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  27.37 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  29.88 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  22.81 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  24.22 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887000000000001e-20 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3848  hypothetical protein  43.64 
 
 		 109 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3775  hypothetical protein  43.64 
 
 		 109 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>