28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1942 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  635    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  44.44 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  40.33 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  32.99 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  34.47 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  30.23 
 
 		 294 aa  139  7e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  30.87 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  30.95 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  31.09 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  30.74 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  30.65 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  34.93 
 
 		 324 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  31.49 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  26.67 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  27.21 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  28.47 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  27.27 
 
 		 334 aa  97.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  23.93 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  29.37 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  28.28 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887000000000001e-20 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  24.91 
 
 		 284 aa  79  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  25.71 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  31.96 
 
 		 102 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  31.96 
 
 		 102 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  26.47 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1147  hypothetical protein  34.02 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3080  hypothetical protein  34.87 
 
 		 157 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0503  hypothetical protein  27.03 
 
 		 277 aa  43.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>