29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0619 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0619  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  648    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0232  hypothetical protein  51.45 
 
 		 313 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.227271  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2410  hypothetical protein  49.53 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1152  hypothetical protein  48.06 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4747  methionine sulfoxide reductase A  37.97 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  normal  0.0101893 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0486  hypothetical protein  35.96 
 
 		 281 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013307 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0553  hypothetical protein, putative phage gene  39.06 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.070631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0087  methionine sulfoxide reductase A  36.62 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000549703  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2394  hypothetical protein  35.22 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000000539888  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5903  methionine sulfoxide reductase A  34.01 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3168  hypothetical protein  35.2 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1829  methionine sulfoxide reductase A  29.66 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3728  hypothetical protein  36.48 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.926929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0802  hypothetical protein  30.82 
 
 		 279 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000020853  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3776  hypothetical protein  59.05 
 
 		 102 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3849  hypothetical protein  59.05 
 
 		 102 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1942  hypothetical protein  30.65 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.350781  normal  0.226641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2225  hypothetical protein  30.25 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0918911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1217  hypothetical protein  28.39 
 
 		 299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3159  methionine sulfoxide reductase A  31.83 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.414524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0622  hypothetical protein  27.46 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0123  excinuclease ABC subunit C  32.32 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1485  hypothetical protein  26.35 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3848  hypothetical protein  58.33 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3775  hypothetical protein  58.33 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1177  hypothetical protein  21.02 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.027744  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03110  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0440905  hitchhiker  1.2887000000000001e-20 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0296  hypothetical protein  35.24 
 
 		 375 aa  47  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3080  hypothetical protein  34.69 
 
 		 157 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.779637  normal  0.178207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>