62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5737 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  100 
 
 
711 aa  1468    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  43.67 
 
 
751 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  36.56 
 
 
759 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  39.94 
 
 
706 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  40.23 
 
 
706 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  39.65 
 
 
706 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  36.9 
 
 
710 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  34.43 
 
 
701 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  35.66 
 
 
713 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  34.4 
 
 
714 aa  343  9e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  32.82 
 
 
688 aa  333  5e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  28.02 
 
 
722 aa  194  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  26.66 
 
 
718 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  26.58 
 
 
704 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  25.41 
 
 
714 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  27.56 
 
 
941 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  26.71 
 
 
721 aa  181  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  27.75 
 
 
731 aa  178  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  26.34 
 
 
729 aa  177  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  27.55 
 
 
734 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  26.79 
 
 
732 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  26.75 
 
 
732 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  27.23 
 
 
743 aa  173  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  27.45 
 
 
718 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  26.65 
 
 
732 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  26.75 
 
 
739 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  26.21 
 
 
732 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  27.45 
 
 
718 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  27.3 
 
 
718 aa  171  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  27.3 
 
 
718 aa  170  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  28.53 
 
 
732 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  28.09 
 
 
716 aa  169  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  27.75 
 
 
732 aa  169  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  27.14 
 
 
732 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  27.06 
 
 
712 aa  168  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  27.88 
 
 
732 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  27.23 
 
 
718 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  26.07 
 
 
721 aa  168  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  24.41 
 
 
725 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  26.16 
 
 
767 aa  167  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  27.07 
 
 
740 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  27.79 
 
 
732 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  26.95 
 
 
718 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  27.66 
 
 
718 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  26.68 
 
 
731 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  27.6 
 
 
718 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  27.11 
 
 
718 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  27.66 
 
 
718 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  27.66 
 
 
718 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  26.42 
 
 
718 aa  164  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  28.89 
 
 
707 aa  163  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  27.01 
 
 
718 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  27.5 
 
 
732 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  28.21 
 
 
718 aa  161  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  28.14 
 
 
716 aa  161  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  29.25 
 
 
720 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  26.87 
 
 
715 aa  134  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  28.57 
 
 
714 aa  125  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  28.79 
 
 
738 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  28.9 
 
 
786 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  28.4 
 
 
720 aa  110  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  32.77 
 
 
718 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>