62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1178 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  47.94 
 
 		 759 aa  646    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  100 
 
 		 751 aa  1523    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  42.06 
 
 		 711 aa  549  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  34.62 
 
 		 701 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  39.54 
 
 		 706 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  39.26 
 
 		 706 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  38.59 
 
 		 706 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  37.87 
 
 		 710 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  35.53 
 
 		 713 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  34.06 
 
 		 688 aa  337  5e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  33.72 
 
 		 714 aa  318  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  29.2 
 
 		 734 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  27.22 
 
 		 718 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  29.4 
 
 		 740 aa  220  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  29.62 
 
 		 739 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  28.45 
 
 		 732 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  28.23 
 
 		 732 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  28.09 
 
 		 732 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  27.78 
 
 		 732 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  28.17 
 
 		 732 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  28.17 
 
 		 732 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  27.89 
 
 		 732 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  26.49 
 
 		 721 aa  211  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  28.71 
 
 		 743 aa  210  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  27.62 
 
 		 732 aa  209  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  27.98 
 
 		 732 aa  208  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  28.57 
 
 		 718 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  27.79 
 
 		 729 aa  206  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  28.05 
 
 		 718 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  27.57 
 
 		 718 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  27.57 
 
 		 718 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  27.55 
 
 		 941 aa  204  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  27.76 
 
 		 718 aa  204  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  27.21 
 
 		 718 aa  204  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  29.11 
 
 		 718 aa  203  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  27.79 
 
 		 718 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  28.43 
 
 		 718 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  27.92 
 
 		 716 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  27.59 
 
 		 718 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  26.5 
 
 		 722 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  27.06 
 
 		 718 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  27.43 
 
 		 731 aa  199  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  28.35 
 
 		 731 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  27.62 
 
 		 718 aa  197  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  26.58 
 
 		 767 aa  197  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  26.84 
 
 		 716 aa  195  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  28.84 
 
 		 707 aa  195  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  28.36 
 
 		 786 aa  194  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  27.37 
 
 		 721 aa  194  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  27.69 
 
 		 718 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  27.05 
 
 		 738 aa  190  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  27.33 
 
 		 718 aa  190  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  25.63 
 
 		 704 aa  188  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  27.94 
 
 		 732 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  25.64 
 
 		 714 aa  184  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  27.5 
 
 		 720 aa  180  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  26.49 
 
 		 720 aa  180  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  23.95 
 
 		 725 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  25.86 
 
 		 712 aa  174  5e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  27.83 
 
 		 715 aa  165  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  30.3 
 
 		 714 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  29.38 
 
 		 718 aa  140  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>