62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1075 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  47.01 
 
 		 743 aa  688    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  91.91 
 
 		 718 aa  1380    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  44.93 
 
 		 732 aa  679    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  47.7 
 
 		 734 aa  710    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  45.8 
 
 		 732 aa  681    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  91.21 
 
 		 718 aa  1372    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  45.47 
 
 		 732 aa  685    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  91.91 
 
 		 718 aa  1379    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  47 
 
 		 740 aa  685    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  82.17 
 
 		 718 aa  1252    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  80.92 
 
 		 718 aa  1230    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  83.84 
 
 		 718 aa  1252    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  45.2 
 
 		 732 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  91.91 
 
 		 718 aa  1380    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  81.48 
 
 		 718 aa  1237    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  47.14 
 
 		 739 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  91.77 
 
 		 718 aa  1376    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  45.71 
 
 		 716 aa  650    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  45.87 
 
 		 707 aa  654    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  45.54 
 
 		 720 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  54.49 
 
 		 721 aa  784    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  45.2 
 
 		 732 aa  679    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  78.52 
 
 		 738 aa  1162    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  57.94 
 
 		 731 aa  884    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  100 
 
 		 718 aa  1493    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  46.07 
 
 		 732 aa  684    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  47.63 
 
 		 731 aa  686    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  78.69 
 
 		 718 aa  1212    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  95.26 
 
 		 718 aa  1422    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  46.07 
 
 		 732 aa  686    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  46.21 
 
 		 732 aa  688    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  95.26 
 
 		 718 aa  1422    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  79.36 
 
 		 718 aa  1196    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  47.3 
 
 		 729 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  95.54 
 
 		 718 aa  1426    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  46 
 
 		 941 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  45.93 
 
 		 732 aa  683    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  44.32 
 
 		 716 aa  633  1e-180  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  42.9 
 
 		 732 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  41.51 
 
 		 715 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  39.32 
 
 		 767 aa  513  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  37.89 
 
 		 786 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  32.73 
 
 		 725 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  33.85 
 
 		 714 aa  352  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  33.93 
 
 		 721 aa  348  1e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  31.33 
 
 		 704 aa  346  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  32.08 
 
 		 722 aa  345  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  32.15 
 
 		 714 aa  341  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  31.42 
 
 		 720 aa  319  1e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  31.48 
 
 		 712 aa  311  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  29.52 
 
 		 706 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  28.98 
 
 		 706 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  28.36 
 
 		 701 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  28.73 
 
 		 706 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  28.81 
 
 		 713 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  29.21 
 
 		 688 aa  223  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  27.84 
 
 		 714 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  37.18 
 
 		 718 aa  221  5e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  27.84 
 
 		 751 aa  193  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  26.5 
 
 		 710 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  25.07 
 
 		 759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  27.6 
 
 		 711 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>