62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3937 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  47.11 
 
 		 743 aa  690    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  85.22 
 
 		 718 aa  1285    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  45.66 
 
 		 732 aa  665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  47.36 
 
 		 734 aa  690    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  46.88 
 
 		 732 aa  677    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  85.36 
 
 		 718 aa  1291    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  45.66 
 
 		 732 aa  665    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  85.5 
 
 		 718 aa  1286    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  46.65 
 
 		 740 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  100 
 
 		 718 aa  1484    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  82.87 
 
 		 718 aa  1253    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  89.42 
 
 		 718 aa  1321    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  45.93 
 
 		 732 aa  665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  85.63 
 
 		 718 aa  1290    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  93.45 
 
 		 718 aa  1400    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  46.91 
 
 		 739 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  85.36 
 
 		 718 aa  1285    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  44.64 
 
 		 716 aa  638    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  45.25 
 
 		 707 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  54.78 
 
 		 721 aa  781    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  45.93 
 
 		 732 aa  667    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  77.68 
 
 		 738 aa  1140    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  47.03 
 
 		 732 aa  679    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  46.88 
 
 		 731 aa  672    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  84.12 
 
 		 718 aa  1264    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  82.17 
 
 		 718 aa  1252    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  48.11 
 
 		 729 aa  690    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  83.12 
 
 		 718 aa  1262    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  47.16 
 
 		 732 aa  683    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  47.16 
 
 		 732 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  83.12 
 
 		 718 aa  1262    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  83.84 
 
 		 718 aa  1244    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  45.24 
 
 		 941 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  47.3 
 
 		 732 aa  682    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  59.33 
 
 		 731 aa  895    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  83.12 
 
 		 718 aa  1261    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  43.41 
 
 		 716 aa  626  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  43.65 
 
 		 720 aa  615  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  42.98 
 
 		 732 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  39.09 
 
 		 715 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  38.86 
 
 		 767 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  38.17 
 
 		 786 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  33.43 
 
 		 725 aa  379  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  31.79 
 
 		 704 aa  347  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  32.1 
 
 		 721 aa  345  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  31.56 
 
 		 722 aa  337  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  33.94 
 
 		 714 aa  334  3e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  31.81 
 
 		 712 aa  311  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  30.61 
 
 		 720 aa  294  5e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  39.62 
 
 		 714 aa  244  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  27.78 
 
 		 714 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  36.71 
 
 		 718 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  28.27 
 
 		 713 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  27.5 
 
 		 706 aa  214  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  27.16 
 
 		 701 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  27.36 
 
 		 706 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  27.84 
 
 		 688 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  26.81 
 
 		 706 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  27.06 
 
 		 751 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  25.87 
 
 		 710 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  26.95 
 
 		 711 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  24.02 
 
 		 759 aa  165  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>