62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0416 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1768  dipeptidyl-peptidase 7  58.39 
 
 
721 aa  840    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0506828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0416  hypothetical protein  100 
 
 
714 aa  1480    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0905126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0849  hypothetical protein  43.54 
 
 
718 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2431  dipeptidyl-peptidase 7  41.02 
 
 
704 aa  538  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2984  hypothetical protein  42.02 
 
 
722 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0404  dipeptidyl-peptidase 7  38.2 
 
 
714 aa  473  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1283  hypothetical protein  36.33 
 
 
720 aa  459  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0491  hypothetical protein  35.55 
 
 
712 aa  432  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0692  hypothetical protein  33.83 
 
 
731 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01009  hypothetical protein  32.88 
 
 
721 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00499323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2038  hypothetical protein  33.33 
 
 
725 aa  359  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302869  hitchhiker  0.00293045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0898  hypothetical protein  32.79 
 
 
718 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0642  hypothetical protein  33.6 
 
 
718 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605544  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1344  hypothetical protein  31.56 
 
 
732 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.818075  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3587  hypothetical protein  32.24 
 
 
718 aa  344  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115853  normal  0.956669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3464  hypothetical protein  32.24 
 
 
718 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0949  dipeptidyl-peptidase 7  31.97 
 
 
718 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0576142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3025  dipeptidyl-peptidase 7  31.97 
 
 
718 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0913  dipeptidyl-peptidase 7  31.97 
 
 
718 aa  342  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365403  normal  0.893813 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3388  hypothetical protein  32.39 
 
 
718 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0917  hypothetical protein  32.8 
 
 
718 aa  342  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.14142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1075  hypothetical protein  32.15 
 
 
718 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0573  hypothetical protein  33.15 
 
 
718 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2938  hypothetical protein  33.19 
 
 
738 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3877  hypothetical protein  33.61 
 
 
718 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.286815  hitchhiker  0.0000320991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3187  hypothetical protein  32.23 
 
 
718 aa  332  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.828747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3279  hypothetical protein  31.83 
 
 
734 aa  332  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00632369  unclonable  0.00000414607 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02510  hypothetical protein  30.35 
 
 
707 aa  323  9.000000000000001e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5731  Peptidase S46  30.25 
 
 
786 aa  320  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521337  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3582  hypothetical protein  31.2 
 
 
743 aa  320  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000436948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3639  hypothetical protein  29.6 
 
 
732 aa  318  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00188388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0715  hypothetical protein  29.59 
 
 
732 aa  317  6e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0684  hypothetical protein  30.52 
 
 
718 aa  317  6e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0176519  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0959  hypothetical protein  30.37 
 
 
716 aa  317  7e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00114251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0807  hypothetical protein  32.13 
 
 
720 aa  316  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.661422  normal  0.0291008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0757  hypothetical protein  30.9 
 
 
732 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000601769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0736  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  29.47 
 
 
732 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00943685  hitchhiker  0.00000000353181 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0761  hypothetical protein  30.4 
 
 
740 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000133423  hitchhiker  0.0000000733664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0745  hypothetical protein  29.47 
 
 
732 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00110202  hitchhiker  0.000231819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0691  dipeptidyl-peptidase 7  29.2 
 
 
732 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000153124  hitchhiker  0.000504584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3249  dipeptidyl-peptidase 7  29.8 
 
 
732 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101755  hitchhiker  0.0000935307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4208  hypothetical protein  29.64 
 
 
739 aa  310  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000122811  hitchhiker  0.000560321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5484  Peptidase S46  31.15 
 
 
767 aa  309  9e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0712  dipeptidyl-peptidase 7  29.46 
 
 
732 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00861513  hitchhiker  0.000040961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3918  hypothetical protein  29.66 
 
 
732 aa  306  6e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3979  hypothetical protein  31.53 
 
 
715 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137716  normal  0.400863 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1078  hypothetical protein  29.61 
 
 
716 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000205718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0520  hypothetical protein  29.47 
 
 
731 aa  300  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00489252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3347  hypothetical protein  29.84 
 
 
941 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3937  hypothetical protein  39.62 
 
 
718 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.631088  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2277  dipeptidyl-peptidase 7  27.82 
 
 
701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0618  hypothetical protein  26.78 
 
 
710 aa  213  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3059  hypothetical protein  35.38 
 
 
729 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000942986  normal  0.160447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3344  dipeptidyl-peptidase 7  25.37 
 
 
706 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5737  Peptidase S46  25.41 
 
 
711 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.654767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0494  hypothetical protein  25.44 
 
 
688 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1178  Dipeptidyl-peptidase 7  31.18 
 
 
751 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3411  hypothetical protein  29.9 
 
 
713 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490577  normal  0.207662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3425  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  28.49 
 
 
706 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00839556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3489  Dipeptidyl-peptidase 7. Serine peptidase. MEROPS family S46  27.65 
 
 
706 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1179  dipeptidyl-peptidase 7  27.4 
 
 
759 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2591  dipeptidyl-peptidase 7  29.77 
 
 
714 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>