47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1245 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1245  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2626  hypothetical protein  85.71 
 
 		 127 aa  214  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0922  hypothetical protein  83.2 
 
 		 127 aa  213  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0400088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  47.93 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0639  protein of unknown function DUF1044  43.65 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12836  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  46.28 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3645  hypothetical protein  45.97 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.801747  hitchhiker  0.0000000000510649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1231  hypothetical protein  42.28 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  43.31 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  41.13 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4183  hypothetical protein  41.73 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  38.89 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  42.5 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  40.98 
 
 		 128 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  43.86 
 
 		 116 aa  95.9  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  39.67 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  40.83 
 
 		 172 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  39.67 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0851  hypothetical protein  38.28 
 
 		 129 aa  93.6  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152374  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  37.3 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0155  hypothetical protein  44.72 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.77632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2086  hypothetical protein  44.55 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.984543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4308  hypothetical protein  42.06 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00337964  normal  0.132689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4311  protein of unknown function DUF1044  40.91 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0427223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0470  hypothetical protein  39.17 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2545  protein of unknown function DUF1044  35.19 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2182  protein of unknown function DUF1044  38.84 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.455247  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  34.34 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1781  protein of unknown function DUF1044  30.09 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1502  hypothetical protein  30.09 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0053a  hypothetical protein  38.46 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0293608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0894  hypothetical protein  31.2 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0861  hypothetical protein  31.2 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2808  hypothetical protein  31.2 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4026  hypothetical protein  28.23 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0987  hypothetical protein  29.6 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.469409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5090  hypothetical protein  28.23 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0267211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3695  protein of unknown function DUF1044  27.64 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2983  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2369  hypothetical protein  28.57 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2893  hypothetical protein  35.06 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1496  hypothetical protein  29.76 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.244659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3030  hypothetical protein  33.7 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3003  hypothetical protein  27.73 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2678  hypothetical protein  35.06 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6332  hypothetical protein  29.41 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0124  hypothetical protein  28.93 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>