42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0124 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0124  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2983  hypothetical protein  64.17 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2369  hypothetical protein  64.17 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6332  hypothetical protein  61.67 
 
 		 121 aa  146  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3030  hypothetical protein  62.5 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3003  hypothetical protein  63.33 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2893  hypothetical protein  61.67 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3695  protein of unknown function DUF1044  51.3 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4026  hypothetical protein  43.86 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3985  putative cytoplasmic protein  44.92 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4057  putative cytoplasmic protein  46.49 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.197527  normal  0.223407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4003  putative cytoplasmic protein  46.49 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4108  hypothetical protein  44.92 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5090  hypothetical protein  42.98 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0267211 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4173  hypothetical protein  44.92 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.723164  normal  0.992967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1781  protein of unknown function DUF1044  44.83 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1502  hypothetical protein  44.83 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1496  hypothetical protein  48.24 
 
 		 89 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.244659 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  32.5 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  31.67 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  43.3 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  35.14 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  37.19 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  36.44 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  38.14 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  32.79 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  29.82 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  32.26 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  30.08 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  33.61 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0861  hypothetical protein  31.2 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2808  hypothetical protein  31.2 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0894  hypothetical protein  31.2 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  34.41 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0639  protein of unknown function DUF1044  31.01 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12836  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2545  protein of unknown function DUF1044  26.13 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2086  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.984543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2182  protein of unknown function DUF1044  34.38 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.455247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1245  hypothetical protein  28.93 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0987  hypothetical protein  29.6 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.469409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4183  hypothetical protein  39.18 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4308  hypothetical protein  31.01 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00337964  normal  0.132689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>