51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3645 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3645  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  250  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.801747  hitchhiker  0.0000000000510649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1245  hypothetical protein  45.97 
 
 		 127 aa  111  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2626  hypothetical protein  45.76 
 
 		 127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  39.52 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1231  hypothetical protein  43.97 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0922  hypothetical protein  43.09 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0400088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0639  protein of unknown function DUF1044  43.97 
 
 		 129 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12836  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  41.32 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  41.32 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  41.44 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  39.34 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  38.89 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0851  hypothetical protein  39.68 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152374  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4183  hypothetical protein  40.83 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  36.59 
 
 		 128 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  40.65 
 
 		 123 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  42.27 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4311  protein of unknown function DUF1044  43.48 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0427223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0155  hypothetical protein  43.9 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.77632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  42.31 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  37.84 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  39.78 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2545  protein of unknown function DUF1044  37.39 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2086  hypothetical protein  45.05 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.984543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4308  hypothetical protein  37.9 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00337964  normal  0.132689 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2182  protein of unknown function DUF1044  41.32 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.455247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0470  hypothetical protein  36.67 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0053a  hypothetical protein  37.18 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0293608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0894  hypothetical protein  33.6 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2808  hypothetical protein  33.6 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0861  hypothetical protein  33.6 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4026  hypothetical protein  30.89 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1502  hypothetical protein  31.9 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1781  protein of unknown function DUF1044  31.9 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6332  hypothetical protein  35.29 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3030  hypothetical protein  34.17 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5090  hypothetical protein  30.08 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0267211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3003  hypothetical protein  34.17 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2369  hypothetical protein  35 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2983  hypothetical protein  35 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0987  hypothetical protein  33.6 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.469409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3695  protein of unknown function DUF1044  26.4 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4003  putative cytoplasmic protein  30 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3985  putative cytoplasmic protein  30 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4057  putative cytoplasmic protein  30 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.197527  normal  0.223407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4108  hypothetical protein  29.17 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1496  hypothetical protein  32.93 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.244659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2678  hypothetical protein  40.26 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4173  hypothetical protein  28.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.723164  normal  0.992967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>