51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1535 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  299  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  55.56 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  47.95 
 
 		 172 aa  143  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  50.39 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  48.39 
 
 		 124 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4183  hypothetical protein  46.83 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2086  hypothetical protein  54.17 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.984543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  40.83 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  40.34 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  46.6 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1245  hypothetical protein  42.5 
 
 		 127 aa  100  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0922  hypothetical protein  41.6 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0400088  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  40.35 
 
 		 116 aa  97.8  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  40.83 
 
 		 123 aa  98.2  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4311  protein of unknown function DUF1044  41.27 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0427223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0639  protein of unknown function DUF1044  38.89 
 
 		 129 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12836  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  39.17 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  38.33 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2626  hypothetical protein  42.02 
 
 		 127 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1231  hypothetical protein  40.17 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0155  hypothetical protein  39.53 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.77632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  35.71 
 
 		 126 aa  90.5  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3645  hypothetical protein  37.5 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.801747  hitchhiker  0.0000000000510649 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4308  hypothetical protein  40.31 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00337964  normal  0.132689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3985  putative cytoplasmic protein  37.78 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5090  hypothetical protein  36.44 
 
 		 117 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0267211 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3695  protein of unknown function DUF1044  38.1 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0861  hypothetical protein  36.72 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2808  hypothetical protein  36.72 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0894  hypothetical protein  36.72 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4057  putative cytoplasmic protein  40 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.197527  normal  0.223407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4003  putative cytoplasmic protein  40 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2545  protein of unknown function DUF1044  32.23 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0851  hypothetical protein  28.91 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152374  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4173  hypothetical protein  37.04 
 
 		 134 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.723164  normal  0.992967 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4026  hypothetical protein  34.75 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686403 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4108  hypothetical protein  37.04 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0987  hypothetical protein  35.16 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.469409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0470  hypothetical protein  50.63 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0053a  hypothetical protein  38.55 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0293608  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1502  hypothetical protein  37.1 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1781  protein of unknown function DUF1044  37.1 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2182  protein of unknown function DUF1044  36.29 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.455247  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0124  hypothetical protein  43.3 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6332  hypothetical protein  34.71 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2893  hypothetical protein  34.45 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3030  hypothetical protein  33.61 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2369  hypothetical protein  33.61 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2983  hypothetical protein  33.61 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3003  hypothetical protein  32.77 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1496  hypothetical protein  32.95 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.244659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>