42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4003 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4003  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 119 aa  247  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3985  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 134 aa  247  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4057  putative cytoplasmic protein  100 
 
 		 119 aa  247  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.197527  normal  0.223407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4108  hypothetical protein  98.32 
 
 		 134 aa  243  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4173  hypothetical protein  97.48 
 
 		 134 aa  241  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.723164  normal  0.992967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3695  protein of unknown function DUF1044  76.27 
 
 		 119 aa  187  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4026  hypothetical protein  68.38 
 
 		 117 aa  169  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5090  hypothetical protein  67.52 
 
 		 117 aa  166  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0267211 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1502  hypothetical protein  50.89 
 
 		 133 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1781  protein of unknown function DUF1044  50.89 
 
 		 133 aa  120  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1496  hypothetical protein  57.3 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.244659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0124  hypothetical protein  46.49 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6332  hypothetical protein  46.43 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3003  hypothetical protein  46.43 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2369  hypothetical protein  45.54 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2983  hypothetical protein  45.54 
 
 		 121 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3030  hypothetical protein  43.75 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2893  hypothetical protein  44.64 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  36.67 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  35.83 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  31.97 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  34.17 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  33.04 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  31.97 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  35.83 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  36.97 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  32.23 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2545  protein of unknown function DUF1044  31.3 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3645  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.801747  hitchhiker  0.0000000000510649 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2808  hypothetical protein  31.5 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0894  hypothetical protein  31.5 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0861  hypothetical protein  31.5 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2182  protein of unknown function DUF1044  30 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.455247  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  34.52 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  27.83 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0155  hypothetical protein  36.67 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.77632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0987  hypothetical protein  30.71 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.469409 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0851  hypothetical protein  24.59 
 
 		 129 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152374  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4183  hypothetical protein  32 
 
 		 128 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2086  hypothetical protein  31.76 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.984543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>