45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1231 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1231  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  263  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0639  protein of unknown function DUF1044  72.58 
 
 		 129 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12836  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1245  hypothetical protein  42.28 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  44.92 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3645  hypothetical protein  43.97 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.801747  hitchhiker  0.0000000000510649 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  41.46 
 
 		 126 aa  103  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2626  hypothetical protein  40.5 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  39.52 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0922  hypothetical protein  39.67 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0400088  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  40.17 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  36.59 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  39.67 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4183  hypothetical protein  38.84 
 
 		 128 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  37.29 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  38.39 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  38.39 
 
 		 121 aa  88.2  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  37.61 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  35.54 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0851  hypothetical protein  33.06 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152374  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  34.51 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2086  hypothetical protein  40.59 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.984543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0470  hypothetical protein  38.84 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4311  protein of unknown function DUF1044  35.59 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0427223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4308  hypothetical protein  36.72 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00337964  normal  0.132689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  38.3 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0053a  hypothetical protein  34.62 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0293608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2808  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0861  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0894  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0155  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.77632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2182  protein of unknown function DUF1044  37.36 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.455247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0987  hypothetical protein  29.09 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.469409 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2545  protein of unknown function DUF1044  28.32 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6332  hypothetical protein  34.78 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2893  hypothetical protein  35.34 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2983  hypothetical protein  34.48 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2369  hypothetical protein  34.48 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3030  hypothetical protein  34.48 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3003  hypothetical protein  33.62 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5090  hypothetical protein  30.56 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0267211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3536  hypothetical protein  35.37 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4026  hypothetical protein  29.63 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686403 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2678  hypothetical protein  42.22 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1781  protein of unknown function DUF1044  28.57 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1502  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>