47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0639 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0639  protein of unknown function DUF1044  100 
 
 
129 aa  263  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12836  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1231  hypothetical protein  72.58 
 
 
128 aa  196  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  45.83 
 
 
125 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1245  hypothetical protein  43.65 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  43.09 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2626  hypothetical protein  42.86 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0922  hypothetical protein  43.65 
 
 
127 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0400088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  37.3 
 
 
126 aa  104  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3645  hypothetical protein  43.97 
 
 
125 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.801747  hitchhiker  0.0000000000510649 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  41.67 
 
 
121 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  41.67 
 
 
121 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  38.89 
 
 
144 aa  97.1  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0851  hypothetical protein  34.88 
 
 
129 aa  96.3  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152374  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  37.9 
 
 
124 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  38.33 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  34.13 
 
 
172 aa  87.4  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  38.76 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  33.33 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4183  hypothetical protein  35.71 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  39.78 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4311  protein of unknown function DUF1044  38.89 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0427223  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  32.74 
 
 
116 aa  76.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0470  hypothetical protein  38.21 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542672  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2086  hypothetical protein  37.23 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.984543  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4308  hypothetical protein  32.5 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00337964  normal  0.132689 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0053a  hypothetical protein  39.24 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0293608  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2182  protein of unknown function DUF1044  35.4 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.455247  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2545  protein of unknown function DUF1044  30.97 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0894  hypothetical protein  29.36 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2808  hypothetical protein  29.36 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0861  hypothetical protein  29.36 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0155  hypothetical protein  49.02 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.77632  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0987  hypothetical protein  29.36 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.469409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2369  hypothetical protein  31.93 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2983  hypothetical protein  31.93 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6332  hypothetical protein  34.13 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2678  hypothetical protein  42.22 
 
 
110 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3003  hypothetical protein  31.09 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0124  hypothetical protein  31.01 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2893  hypothetical protein  32.5 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3030  hypothetical protein  31.67 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3695  protein of unknown function DUF1044  25 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5090  hypothetical protein  27.78 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0267211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3536  hypothetical protein  31.73 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4026  hypothetical protein  27.78 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.686403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1502  hypothetical protein  28.16 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24964  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1781  protein of unknown function DUF1044  28.16 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.245203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>