39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6332 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6332  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2983  hypothetical protein  82.64 
 
 
121 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2369  hypothetical protein  82.64 
 
 
121 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3030  hypothetical protein  81.82 
 
 
121 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2893  hypothetical protein  82.64 
 
 
121 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3003  hypothetical protein  80.99 
 
 
121 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0124  hypothetical protein  61.67 
 
 
121 aa  146  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3695  protein of unknown function DUF1044  51.75 
 
 
119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1781  protein of unknown function DUF1044  47.46 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1502  hypothetical protein  47.46 
 
 
133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24964  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4026  hypothetical protein  45.54 
 
 
117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.686403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3985  putative cytoplasmic protein  45.22 
 
 
134 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5090  hypothetical protein  45.54 
 
 
117 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0267211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4003  putative cytoplasmic protein  46.43 
 
 
119 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4057  putative cytoplasmic protein  46.43 
 
 
119 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.197527  normal  0.223407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4108  hypothetical protein  45.22 
 
 
134 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4173  hypothetical protein  45.22 
 
 
134 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.723164  normal  0.992967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1496  hypothetical protein  48.24 
 
 
89 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.244659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  40.5 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  33.61 
 
 
126 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  34.71 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  30.83 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  30 
 
 
121 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  36.44 
 
 
172 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3645  hypothetical protein  35.29 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.801747  hitchhiker  0.0000000000510649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  40.82 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  35 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  30.63 
 
 
124 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1231  hypothetical protein  34.78 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  30.89 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  33.61 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0639  protein of unknown function DUF1044  34.13 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12836  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2182  protein of unknown function DUF1044  33.61 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.455247  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  27.36 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0470  hypothetical protein  32.8 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542672  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  36.14 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1245  hypothetical protein  29.41 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2545  protein of unknown function DUF1044  27.19 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0922  hypothetical protein  29.47 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0400088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>