41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3030 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3030  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2893  hypothetical protein  97.52 
 
 		 121 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2983  hypothetical protein  92.56 
 
 		 121 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2369  hypothetical protein  92.56 
 
 		 121 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3003  hypothetical protein  90.91 
 
 		 121 aa  215  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6332  hypothetical protein  81.82 
 
 		 121 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0124  hypothetical protein  62.5 
 
 		 121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3695  protein of unknown function DUF1044  50 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1781  protein of unknown function DUF1044  47.46 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1502  hypothetical protein  47.46 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4026  hypothetical protein  42.86 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5090  hypothetical protein  41.96 
 
 		 117 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0267211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3985  putative cytoplasmic protein  42.61 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4003  putative cytoplasmic protein  43.75 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4057  putative cytoplasmic protein  43.75 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.197527  normal  0.223407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4108  hypothetical protein  42.61 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4173  hypothetical protein  42.61 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.723164  normal  0.992967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1496  hypothetical protein  48.24 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.244659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  32.77 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  39.67 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  33.61 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  33.9 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  29.17 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3645  hypothetical protein  34.17 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.801747  hitchhiker  0.0000000000510649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  38.54 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  30.63 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  29.29 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2545  protein of unknown function DUF1044  29.41 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  31.93 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  30.83 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1245  hypothetical protein  33.7 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1231  hypothetical protein  34.48 
 
 		 128 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  31.33 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  29.6 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4311  protein of unknown function DUF1044  33.33 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0427223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0639  protein of unknown function DUF1044  31.67 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12836  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2626  hypothetical protein  30.53 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0922  hypothetical protein  28.42 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0400088  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2182  protein of unknown function DUF1044  32 
 
 		 124 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.455247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0470  hypothetical protein  33.08 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>